Objetivos: Objetivo general Ser capaz de interpretar con precisión el volumen de información clínica disponible actualmente y asociado a los datos biológicos que se generan tras un análisis bioinformático. Objetivos específicos Poner en práctica los conocimientos adquiridos para la interpretación de un estudio genómico en varios casos de cáncer mediante la extracción de información útil que ayude a la toma de decisiones. Utilización de diversos algoritmos realizados con el lenguaje R para la extracción de conocimiento desde las bases de datos Pubmed, DGIdb y Clinical Trials a partir de la búsqueda de información genética en determinados tumores. Conocer la función de genes con escasa información clínica en base a la proximidad ontológica. Descubrir genes implicados en una enfermedad en base a una búsqueda masiva en Pubmed y representación gráfica del nivel evidencia científico.
A quién va dirigido: El Curso Universitario en Aplicación de la Bioinformática Oncología Genómica está orientado a facilitar la actuación del médico dedicado al tratamiento de la patología oncológica en la que es preciso interpretar con precisión el volumen ingente de información clínica disponible actualmente y asociarlo a los datos biológicos que se generan tras un análisis bioinformático.
Duración: 2 meses
Modulo 1. Aplicación de la bioinformática en la oncología genómica
1.1. Enriquecimiento clínico y farmacológico de variantes de genes.
1.2. Búsqueda masiva en PubMed de información genómica.
1.3. Búsqueda masiva en DGIdb de información genómica.
1.4. Búsqueda masiva en Clinical Trials de ensayos clínicos sobre datos genómicos.
1.5. Búsqueda de similitud de genes para la interpretación de un panel genético o un exoma.
1.6. Búsqueda masiva de genes relacionados con una enfermedad.
1.7. Enrich-Gen: Plataforma de enriquecimiento clínico y farmacológico de genes.
1.8. Procedimiento para realizar un informe genómico en la era de la oncología de precisión.
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